286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2014 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  100 
 
 		 222 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  82.43 
 
 		 222 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  82.43 
 
 		 222 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  84.23 
 
 		 222 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  82.43 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  80.63 
 
 		 222 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  81.08 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  80.63 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  81.08 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  80.18 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  80.63 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  80.18 
 
 		 222 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  74.32 
 
 		 222 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  75.11 
 
 		 233 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  73.42 
 
 		 222 aa  347  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  73.87 
 
 		 222 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  72.52 
 
 		 222 aa  344  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  63.01 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  61.36 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  57.66 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  58.11 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  58.11 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  58.11 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  58.11 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  55.45 
 
 		 226 aa  278  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  56.76 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  58.56 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  57.66 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  55.86 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  57.66 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  56.76 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  56.76 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  54.75 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  56.76 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  56.76 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  56.05 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  56.36 
 
 		 226 aa  264  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  57.27 
 
 		 226 aa  257  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  56.28 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  52.44 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  50.66 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  46.75 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  46.22 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.56 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.84 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  34.09 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  34.39 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  32.88 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  33.03 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  32.89 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.84 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.48 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  33.78 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  33.63 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  30.96 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  32.22 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  30.54 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  31.51 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.16 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  33.33 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  31.86 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  31.76 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  32.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  31.93 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  31.8 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  31.8 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  31.8 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  29.87 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  31.09 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  31.51 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  32.07 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  31.51 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  31.51 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  32.75 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  32.49 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>