279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02385 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  87.5 
 
 		 226 aa  403  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  73.15 
 
 		 245 aa  345  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  64.35 
 
 		 226 aa  301  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  62.96 
 
 		 223 aa  288  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  61.57 
 
 		 223 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  62.04 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  62.04 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  62.04 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  61.11 
 
 		 223 aa  278  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  61.57 
 
 		 223 aa  277  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  60.65 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  62.04 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  60.65 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  60.65 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  59.72 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  61.11 
 
 		 223 aa  275  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  61.57 
 
 		 223 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  58.6 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  57.67 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  57.67 
 
 		 222 aa  257  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  59.53 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  58.8 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  58.14 
 
 		 222 aa  254  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  56.74 
 
 		 222 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  56.74 
 
 		 222 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  60.19 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  56.74 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  55.81 
 
 		 222 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  55.35 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  56.28 
 
 		 222 aa  251  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  57.21 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  56.28 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  56.28 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  56.28 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  56.28 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  54.21 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  53.95 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  53.95 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  56.28 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  51.38 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  45.74 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  47.49 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  33.02 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  33.33 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  36.11 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.87 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  33.95 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  35.19 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  35.29 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.88 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  33.48 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  32.41 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  33.33 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  30.8 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  32.42 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  32.05 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  29.96 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  29.61 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  29.61 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  30.2 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  30.38 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  32.89 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  31.42 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  31.86 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  31.72 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  29.46 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  31.42 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  31.42 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  31.42 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  31.42 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>