274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1124 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  70.85 
 
 		 216 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  60.27 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  57.85 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  58.48 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  57.47 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  56.7 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  56.7 
 
 		 212 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  55.36 
 
 		 211 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  56.5 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  56.7 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  55.16 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  56.05 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  56.05 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  56.05 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  56.05 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  56.05 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  55.16 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  56.05 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  55.61 
 
 		 210 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  54.26 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  52.02 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  54.26 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  54.26 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  56.7 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  54.26 
 
 		 210 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  56.11 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  62.78 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  54.26 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  55.8 
 
 		 211 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  55.8 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  60.09 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  53.12 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  52.91 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  55.61 
 
 		 210 aa  234  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  54.75 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  52.02 
 
 		 210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  57.85 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  57.4 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  52.02 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  52.44 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  57.78 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  56.05 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  57.78 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  54.91 
 
 		 211 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  53.57 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  54.5 
 
 		 209 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  60.18 
 
 		 211 aa  227  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  50.68 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  53.78 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  56.25 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  54.29 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  59.19 
 
 		 210 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  55.36 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  56.95 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  53.54 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  51.54 
 
 		 217 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  58.3 
 
 		 209 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  52.89 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  51.56 
 
 		 212 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  60.99 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  56.99 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  52.44 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  40.64 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  41.7 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  35.53 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  37.28 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.48 
 
 		 195 aa  99  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.51 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  30.89 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  29.54 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  31.33 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.33 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  30.52 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  30.24 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  30.74 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  29.84 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  31.3 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  29.84 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  30.65 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>