276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1161 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  91.98 
 
 		 212 aa  383  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  91.51 
 
 		 212 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  80.95 
 
 		 210 aa  339  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  79.52 
 
 		 210 aa  321  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  76.3 
 
 		 211 aa  316  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  69.38 
 
 		 210 aa  315  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  70.81 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  70.67 
 
 		 211 aa  308  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  75.83 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  68.1 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  68.9 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  69.19 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  67.94 
 
 		 210 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  74.04 
 
 		 211 aa  298  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  72.25 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  67.46 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  64.59 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  64.59 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  63.33 
 
 		 210 aa  288  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  66.51 
 
 		 210 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  63.33 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  63.33 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  63.33 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  63.33 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  63.33 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  61.43 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  61.9 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  65.4 
 
 		 212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  64.32 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  69.52 
 
 		 209 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  79.05 
 
 		 210 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  63.85 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  60.48 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  60.48 
 
 		 210 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  64.29 
 
 		 211 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  63.81 
 
 		 211 aa  277  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  61.14 
 
 		 211 aa  277  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  62.33 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  65.71 
 
 		 211 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  65.24 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  64.93 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  64.32 
 
 		 212 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  68.9 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  64.76 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  64.79 
 
 		 215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  61.9 
 
 		 211 aa  271  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  62.56 
 
 		 212 aa  267  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  63.29 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  60.65 
 
 		 218 aa  262  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  66.67 
 
 		 209 aa  261  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  61.14 
 
 		 212 aa  260  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  54.38 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  55.08 
 
 		 237 aa  252  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  62.94 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  54.21 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  60.65 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  65.4 
 
 		 222 aa  238  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  59.19 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  45 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  39.63 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  39.73 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.64 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  37.21 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  31.43 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  34.86 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  32.91 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.41 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.63 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  32.91 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  33.04 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  31.65 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  33.05 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  31.96 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.8 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  31.65 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  31.22 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  31.65 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  31.8 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  33.48 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  32.77 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  31.44 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  31.19 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.19 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>