277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0318 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  45.61 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  46.44 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  44.12 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  46.86 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  44.17 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  43.8 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  43.75 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  42.92 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  42.26 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  44.17 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  42.92 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  43.28 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  42.5 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  42.5 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  42.5 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  42.92 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  42.92 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  42.92 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  43.93 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  44.35 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  43.33 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  43.7 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  44.54 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  44.54 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  43.1 
 
 		 210 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  41 
 
 		 211 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  45.99 
 
 		 210 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  43.28 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  43.1 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  41.25 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  41.8 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  42.74 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  43.93 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  43.88 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  45.42 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  38.27 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  42.15 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  42.32 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  42.39 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  41.77 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  42.04 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  43.75 
 
 		 210 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  43.21 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  43.7 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  43.09 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  38.11 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  41.74 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  38.95 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  42.26 
 
 		 212 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  40.08 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  41.15 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  39.5 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  37.85 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  44.54 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  41 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 195 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  31.98 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  31.09 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.09 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  31.47 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  28.81 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  31.54 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.33 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  28.74 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  30.2 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  32.76 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  28.51 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  28.51 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  31.25 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  31.93 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  30.71 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  28.51 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  31.12 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  30 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  31.17 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  31.93 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  31.69 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  30.38 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>