More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2837 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  49.79 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  40 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  31.4 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  30.98 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  27.62 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.8 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.8 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.05 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  45.37 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  28.81 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  28.03 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  42.5 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.62 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.46 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  38.53 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  33.54 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  28.23 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.88 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  30.49 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  25.41 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  31.14 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  37.59 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  37.04 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  27.14 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.82 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  38.1 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  30.6 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  42.59 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  36.69 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  31.17 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  37.61 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  30.3 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  27.83 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  27.71 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  37.72 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  30.77 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  25.76 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  37.72 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  37.72 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  29.22 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  29.91 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  29.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>