274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0156 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  98.38 
 
 
247 aa  494  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  97.17 
 
 
247 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  65.06 
 
 
249 aa  338  7e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  52.4 
 
 
256 aa  265  5e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  54.4 
 
 
247 aa  262  4e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  51.98 
 
 
251 aa  246  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  50.4 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  39.73 
 
 
221 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 
258 aa  99.4  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
243 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  25.31 
 
 
251 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  25.68 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
216 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  21.91 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  36.92 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  36.15 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  36.92 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  30.38 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  30.4 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  24.79 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  35.2 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  29.37 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 
235 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  34.85 
 
 
211 aa  62  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  33.61 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  33.6 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  32.81 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  33.08 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  34.69 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  29.8 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  33.86 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  33.6 
 
 
205 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  32.58 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32 
 
 
205 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  29.46 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  33.85 
 
 
212 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  30.15 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.91 
 
 
226 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  33.6 
 
 
205 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  31.54 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  32.81 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  31.75 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  33.58 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  31.75 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  25.2 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  25.35 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  29.93 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  29.93 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  21.83 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  30.47 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  30.16 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  32.56 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  29.92 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  34.62 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>