235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1155 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  71.77 
 
 		 256 aa  358  3e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  52.82 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  52.92 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  53.39 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  52.78 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  51.98 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  51.98 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  37.05 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  34.17 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  28.2 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 209 aa  72  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  34.68 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  29.79 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  39.02 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  28.92 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  31.85 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  31.11 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.37 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  25.5 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  23.6 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  33.83 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  25.86 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  26.8 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  29.32 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  31.54 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  37.69 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  36.76 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  30.23 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  27 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  25 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  30.15 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  31.25 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  31.5 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  31.37 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  31.71 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  29.63 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  33.08 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  37.1 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  33.07 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  37.1 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  28.37 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  28.37 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  35.2 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  36.15 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  27.88 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  32.54 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  25.2 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  28.37 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  28.37 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  28.37 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  25 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  34.92 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  31.11 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  34.65 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  33.07 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  33.09 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  32.26 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  26.19 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  25 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>