273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0327 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  58.7 
 
 
241 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  54.8 
 
 
247 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  54.4 
 
 
247 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  54 
 
 
247 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  53.78 
 
 
249 aa  255  4e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  53.39 
 
 
251 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  49.4 
 
 
256 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  41.78 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 
243 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
274 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  28.81 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  31.01 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  38.28 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
216 aa  72  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  36.18 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  37.4 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  38.28 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  36.43 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  33.58 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  30.24 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  34.62 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  28.65 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  32 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  32.81 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  34.85 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  36.43 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  38.17 
 
 
211 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  37.12 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  25.9 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  34.38 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  35.38 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  32.81 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  26.69 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  36.15 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 
215 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  35.88 
 
 
212 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  35.88 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  35.34 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  35.94 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
202 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  34.62 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  33.59 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  34.62 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  36.51 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  34.62 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  27.09 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  35.94 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  35.38 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  34.62 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  28.33 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  32.8 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  36.72 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  35.94 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.95 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  34.62 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>