36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1914 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 
247 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 
247 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 
247 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 
241 aa  158  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  39.46 
 
 
249 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  37.5 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  37.05 
 
 
251 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.74 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  32.09 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  29.19 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
274 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 
280 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  27.16 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 
230 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.04 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  33.8 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0516  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.06 
 
 
245 aa  42  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0252566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  48.78 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>