255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0222 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  58.7 
 
 
247 aa  281  9e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  52.82 
 
 
251 aa  259  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  50 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  51.2 
 
 
247 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  52.17 
 
 
249 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  50.4 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  50.4 
 
 
247 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  39.19 
 
 
221 aa  158  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.78 
 
 
251 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 
258 aa  95.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  29.15 
 
 
247 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 
274 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 
246 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.83 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  26.61 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  26.61 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  26.21 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  27.35 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  25.6 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  26.42 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.89 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  28.12 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  26.29 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  28.42 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  35.11 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  34 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.8 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  29.6 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  25.11 
 
 
222 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
195 aa  58.5  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  34.35 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  34.45 
 
 
193 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  25.42 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  34.35 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  37.76 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  32.31 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  24.37 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  27 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  24.02 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  29.6 
 
 
205 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  34.62 
 
 
218 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  28.86 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  24.5 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  32.28 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  35.38 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  30.26 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  32.28 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  23.29 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  24.34 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  34.81 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  35.66 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  23.21 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  24.4 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  34.35 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  30.5 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  24.5 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>