More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1418 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  97.21 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  89.77 
 
 		 215 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  83.72 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  84.19 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  83.72 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  85.58 
 
 		 226 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  83.72 
 
 		 215 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  82.24 
 
 		 264 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  81.78 
 
 		 215 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  78.24 
 
 		 193 aa  315  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  70.14 
 
 		 233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  68.25 
 
 		 213 aa  299  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  64.19 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  66.2 
 
 		 213 aa  289  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  66.2 
 
 		 213 aa  289  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  63.72 
 
 		 217 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  65.73 
 
 		 227 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  66.19 
 
 		 216 aa  282  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  63.03 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  62.56 
 
 		 217 aa  278  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  63.98 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  64.45 
 
 		 213 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  61.79 
 
 		 216 aa  267  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  54.67 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  58.96 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  60.28 
 
 		 214 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  60.28 
 
 		 214 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  54.67 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  55.56 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  59.91 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  59.24 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  57.35 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  65.12 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  60.38 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  46.83 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  46.7 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  44.39 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  43.87 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  44.88 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  44.7 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  41.89 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  42.73 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  41.83 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  41.59 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  41.2 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  41.51 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  38.03 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 202 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.02 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.9 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  34.36 
 
 		 253 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  41.9 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 274 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 280 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  36.97 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  33.78 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  31.78 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  40.32 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  36.77 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  36.03 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  35.77 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.96 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.12 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.12 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  31.67 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  28.95 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  27.19 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.92 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  31.67 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  25.12 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  26.75 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  28.26 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>