More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1979 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  70.64 
 
 		 223 aa  313  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  64.71 
 
 		 226 aa  307  9e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  66.36 
 
 		 220 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  61.75 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  58.8 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  57.53 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.49 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  48.82 
 
 		 214 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  48.82 
 
 		 214 aa  195  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  45.97 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  45.75 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  44.81 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  45.33 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  45.02 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  45.33 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 215 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  42.99 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  46.45 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  42.99 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  43.87 
 
 		 215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  44.39 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  42.25 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  45.75 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  44.13 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  46.23 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  42.45 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  42.45 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  41.78 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  45.5 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  42.06 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  43.13 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 245 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  41.15 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  41.04 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  40.71 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  40.93 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  36.05 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  36.45 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  33.18 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  34.27 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.15 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  33.02 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  27.78 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  31.98 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  39.25 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  31.14 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.77 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  26.84 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.73 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  26.22 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  28.83 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  30.68 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.86 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.74 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  31.71 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.8 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  29.74 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  34.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  27.85 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  33.61 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>