More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2336 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  62.09 
 
 
216 aa  285  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  63.51 
 
 
234 aa  284  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  63.51 
 
 
227 aa  284  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 
217 aa  281  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  63.03 
 
 
223 aa  280  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  61.14 
 
 
217 aa  279  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  61.9 
 
 
217 aa  279  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  60.66 
 
 
213 aa  279  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  63.51 
 
 
213 aa  278  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  61.9 
 
 
217 aa  277  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  60.19 
 
 
212 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  61.61 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  60.19 
 
 
264 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  59.91 
 
 
215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  60.19 
 
 
215 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  58.96 
 
 
215 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  59.52 
 
 
214 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  60.19 
 
 
226 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  59.52 
 
 
214 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  58.77 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  58.96 
 
 
215 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  58.49 
 
 
215 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  58.49 
 
 
215 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  58.02 
 
 
215 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  58.49 
 
 
215 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  60.66 
 
 
215 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  57.82 
 
 
213 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  57.82 
 
 
213 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  56.67 
 
 
227 aa  252  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  61.34 
 
 
193 aa  248  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  50 
 
 
244 aa  237  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  49.12 
 
 
244 aa  234  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  52.13 
 
 
232 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  49.12 
 
 
245 aa  230  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  48.06 
 
 
210 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  47.09 
 
 
210 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  47.09 
 
 
210 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  45.15 
 
 
210 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  47.64 
 
 
222 aa  194  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.34 
 
 
215 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  43.54 
 
 
210 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  43.56 
 
 
226 aa  187  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  46.23 
 
 
220 aa  187  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 
223 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  46.45 
 
 
212 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  45.28 
 
 
226 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  44.81 
 
 
223 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  42.72 
 
 
223 aa  175  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  41.51 
 
 
209 aa  170  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  42.65 
 
 
202 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 
202 aa  164  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  40.2 
 
 
234 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 
225 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 
253 aa  131  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
216 aa  102  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  99  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 
258 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  43.93 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 
280 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 
274 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  29.32 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 
216 aa  84.7  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 
260 aa  84.7  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  31.69 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.22 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  34.91 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  35.77 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  31.25 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  29.31 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.68 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.03 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.23 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  26.82 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  27.27 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  26.83 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  28.02 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  33.33 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  25 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>