More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0569 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  63.98 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  61.97 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  59.24 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  60.83 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  58.77 
 
 		 217 aa  268  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  62.09 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  64.32 
 
 		 223 aa  264  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  62.09 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  62.09 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 		 215 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  56.65 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  58.96 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  58.96 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  61.9 
 
 		 216 aa  258  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  60.19 
 
 		 213 aa  258  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  60.38 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  60.85 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  61.79 
 
 		 215 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  60.38 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  59.72 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  59.91 
 
 		 215 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  55.92 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  55.92 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  56.87 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  52.61 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  56.19 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  47.77 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  57.35 
 
 		 214 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  57.35 
 
 		 214 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  46.96 
 
 		 244 aa  232  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  52.13 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  48.15 
 
 		 245 aa  231  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  61.14 
 
 		 193 aa  224  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  46.86 
 
 		 215 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.97 
 
 		 212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 211 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  43.78 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  38.97 
 
 		 210 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  42.44 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  42.93 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  42.93 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  40.67 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  40.85 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  41.04 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  41.95 
 
 		 202 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  39.82 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.59 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  37.56 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  31.28 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 260 aa  89  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.47 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  31.67 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  37.62 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.4 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.86 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.68 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  27.1 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  32.07 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  25.73 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.2 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  29.2 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30.84 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  43.33 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  34.73 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>