More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0779 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  70.51 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  69.19 
 
 		 213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  66.22 
 
 		 227 aa  300  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  67.77 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  65.24 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  66.51 
 
 		 217 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  66.05 
 
 		 217 aa  291  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  64.52 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  64.93 
 
 		 217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  65.71 
 
 		 215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  64.45 
 
 		 217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  63.03 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  64.93 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  64.93 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  64.45 
 
 		 215 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  63.81 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  63.98 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  62.09 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  62.09 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  63.81 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  67.14 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  63.98 
 
 		 215 aa  274  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  63.51 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  62.56 
 
 		 215 aa  270  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  64.32 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  58.9 
 
 		 227 aa  262  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  60.95 
 
 		 214 aa  256  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  60.95 
 
 		 214 aa  256  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  59.52 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  65.8 
 
 		 193 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  51.11 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  50.22 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  50.22 
 
 		 244 aa  237  9e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  49.05 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  50.93 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  46.54 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  46.05 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  47.64 
 
 		 212 aa  188  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  46.51 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  46.45 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  42.51 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  44.59 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  48.17 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  44.39 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  45.41 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  43.38 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  44.06 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.44 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.32 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.6 
 
 		 258 aa  101  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  38.21 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  35.36 
 
 		 260 aa  94.7  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  31.84 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  30.36 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  29.49 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.55 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.64 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  32.17 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  26.58 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  32.17 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  32.17 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.04 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  30.77 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  35.25 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>