More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0505 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  64.71 
 
 		 223 aa  307  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  63.93 
 
 		 220 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  62.39 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  56.88 
 
 		 223 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  57.53 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  55.51 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  49.1 
 
 		 215 aa  214  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  49.29 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  43.87 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  43.12 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  44.91 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  46.05 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  43.6 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  44.34 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  45.5 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  45.28 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  45.75 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  43.64 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  44.5 
 
 		 264 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  45.16 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  45.16 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  45.28 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.62 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  44.86 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  44.6 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  43.38 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  41.36 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  42.86 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  42.73 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  43.78 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  40.69 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  41.56 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  38.46 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  40.91 
 
 		 193 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  34.86 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  34.4 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  34.4 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  37.61 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  33.8 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  37.44 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  34.43 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.47 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  36.28 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  40.65 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  31.11 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.23 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  33.13 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  39.81 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  30.22 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  28.57 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  29.65 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  30.91 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  29.44 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.94 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  30.6 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  25.83 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.77 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  31.74 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  31.25 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  33.57 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  29 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>