More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0896 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  80 
 
 		 244 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  80 
 
 		 244 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  60.27 
 
 		 215 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  59.56 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  57.08 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  56.89 
 
 		 215 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  56 
 
 		 215 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  56 
 
 		 215 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  55.56 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  55.11 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  55.56 
 
 		 215 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  55.56 
 
 		 215 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  55.7 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  52.65 
 
 		 212 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  53.57 
 
 		 217 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  53.33 
 
 		 213 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  53.65 
 
 		 227 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  48.98 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  53.57 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  52.44 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  51.11 
 
 		 223 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  51.21 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  51.11 
 
 		 217 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  54.59 
 
 		 193 aa  238  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  51.11 
 
 		 217 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  52 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  52 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  48.15 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  49.12 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  51.32 
 
 		 215 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  50.67 
 
 		 213 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  51.79 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  50.44 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  50.44 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  42.73 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  45.37 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  42.92 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  43.18 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  42.27 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  41.56 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  40.71 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  40.45 
 
 		 202 aa  148  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.94 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 202 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  35.62 
 
 		 202 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  35.43 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 		 208 aa  99.4  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  31.12 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  30.83 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.83 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.46 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 195 aa  85.1  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  27.8 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  31.53 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.63 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  30.49 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.22 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  39.47 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.17 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.74 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  40.5 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  36.05 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  34.93 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  36.3 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  36.3 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  34.25 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>