More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1772 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  73.36 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  62.92 
 
 		 238 aa  331  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  62.08 
 
 		 238 aa  329  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  62.08 
 
 		 238 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  62.92 
 
 		 238 aa  328  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  62.08 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  62.08 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  62.08 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  62.08 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  63.33 
 
 		 238 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  62.08 
 
 		 238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  62.5 
 
 		 238 aa  325  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  59.84 
 
 		 237 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  59.84 
 
 		 237 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0371  exsD protein  57.34 
 
 		 212 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  52.7 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  47.35 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  48.78 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  47.15 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  45.31 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  45.34 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  45.27 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  45.27 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  44.4 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  44.9 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 202 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.1 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  42.52 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  33.14 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  33.33 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  35.97 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.37 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  32.83 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  30.51 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  28.23 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.37 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  29.13 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  28.4 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  26.94 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  28.87 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  33.64 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  39.06 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  34.81 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  30 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  34.81 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  28.74 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  33.64 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  26.94 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  36.69 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  35.8 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  35.8 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  25.7 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  35.8 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  36.8 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  27.73 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  27.17 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  33.94 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  27.76 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  35.8 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  36.61 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  28.48 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  32.5 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  31.89 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  33.13 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  34.18 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>