More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2847 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  40.89 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  44.07 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 216 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 209 aa  95.5  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.46 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  27.71 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.1 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  31.91 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  31.6 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  29.54 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  25.71 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  32.63 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  29.31 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  25.32 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  28.88 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  29.11 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  29.11 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  38.98 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  28.69 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  28.69 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  28.69 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  28.09 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  28.39 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  29.36 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  28.63 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.99 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  25.91 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.24 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  28.27 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  30.6 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  32.93 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  29 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  28.63 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  33.77 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  28.69 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  27.31 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  28.52 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  28.81 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  26.32 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  29.96 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  28.27 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.24 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>