267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1425 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  65.46 
 
 		 247 aa  341  8e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  65.06 
 
 		 247 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  65.06 
 
 		 247 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  53.78 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  50.58 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  52.92 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  52.17 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  39.46 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  28.08 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  23.79 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 216 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  35.16 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  35.17 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  29.33 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  33.77 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  35.16 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  33.59 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  34.65 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  35.48 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 195 aa  62  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  31.3 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  28.15 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  31.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  35.48 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  31.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  31.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  31.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  31.3 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  31.78 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  31.01 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  33.59 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  30.95 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  33.86 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  31.54 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  31.45 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  32.28 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  30.47 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  31.54 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  32.5 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  29.92 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  30.95 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  31.5 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  33.06 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  30.4 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  29.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  33.96 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  28.95 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  30.95 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  28.03 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  30.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  34.91 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  29.84 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  31.54 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  29.27 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  32.08 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  23.9 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  30.16 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  24.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  34.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>