277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0175 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  97.98 
 
 
247 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  97.17 
 
 
247 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  65.06 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  51.39 
 
 
256 aa  264  8.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  54.8 
 
 
247 aa  263  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  52.78 
 
 
251 aa  250  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  50.4 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  39.73 
 
 
221 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  25.31 
 
 
251 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
274 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  25.3 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  35.38 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  30.4 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  34.85 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  29.75 
 
 
202 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  33.08 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  36.15 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  35.38 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  33.6 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  29.23 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  33.87 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  31.25 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 
209 aa  62  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  25.82 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  34.4 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  33.33 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  34.4 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  34.68 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  29.13 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  30.88 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  29.14 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  24.38 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  33.07 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  34.69 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  30.4 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  34.65 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  26.75 
 
 
216 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  33.08 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  30.66 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  30.89 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 
223 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  32.33 
 
 
211 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.89 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  30.47 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 
210 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  30.47 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 
192 aa  58.5  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30.95 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  32.54 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.12 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  30.47 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  29.13 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  25.85 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>