289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0135 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  536  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  51.98 
 
 		 238 aa  278  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  38.35 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  36.73 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  37.88 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  34.81 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  35.5 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  34.85 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  33.84 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  32.28 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  36.08 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  33.6 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  36.56 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 208 aa  62  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  35.35 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  35.43 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  33.06 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  35.35 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  36.28 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  53.19 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  34.69 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  31.75 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  36.36 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  31.48 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  35.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  31.19 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  36.28 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  32.28 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  31.3 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  30.56 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  28.64 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  33.99 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  29.22 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.2 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.7 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  31.43 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  46.15 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  31.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  31.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  31.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  36.96 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  31.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  31.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  31 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  34.31 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  31.5 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  32.59 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>