More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1785 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  51.78 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  51.22 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  48.77 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  48.76 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  47.54 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  48.96 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  40.23 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  34.59 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  35.71 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  31.33 
 
 		 234 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  30.04 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.24 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  34.31 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.8 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.8 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  35.14 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  30.81 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  29.81 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  24.25 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  34.25 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  27.62 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  24.3 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  37.04 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  36.22 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  34.95 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  32.61 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  34.39 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  34.62 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  28.89 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  36.64 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.4 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  33.33 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  24.55 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  29.01 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  22.78 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  33.1 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  28.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  30.39 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  32.8 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  33.97 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  33.08 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  35.14 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  32.31 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  31.48 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  27.94 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>