297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1258 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  494  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  91.6 
 
 
238 aa  463  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  92.02 
 
 
238 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  91.6 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  92.02 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  91.6 
 
 
238 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  92.02 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  92.02 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  91.18 
 
 
238 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  92.02 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  83.61 
 
 
238 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  67.08 
 
 
245 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  62.92 
 
 
244 aa  328  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  59.41 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  59.41 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0371  exsD protein  56.74 
 
 
212 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  48.1 
 
 
238 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  43.51 
 
 
242 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  44.35 
 
 
242 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  41.25 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  40.83 
 
 
247 aa  194  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  41.39 
 
 
255 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 
246 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  40.66 
 
 
246 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 
245 aa  187  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  38.03 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 
209 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  25.5 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.74 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  25.85 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  37.78 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.85 
 
 
209 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
251 aa  78.2  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  29.11 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  29.76 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.95 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.79 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.95 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  29.27 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  31.76 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  28.24 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  26.98 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  31.22 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  30.91 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  29.48 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  32.26 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.52 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  24.39 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  31.1 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  25.31 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  29.48 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  30.67 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  29.56 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  25.41 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  32.8 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  30.13 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  31.68 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  31.82 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  31.9 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  24.19 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  23.89 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.27 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>