202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0371 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0371  exsD protein  100 
 
 		 212 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  84.43 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  84.43 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  60.37 
 
 		 245 aa  274  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  56.22 
 
 		 238 aa  267  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  56.74 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  57.34 
 
 		 244 aa  264  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  55.35 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  54.42 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  54.88 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  53.95 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  53.95 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  53.95 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  53.95 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  53.95 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  53.49 
 
 		 238 aa  257  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  48.37 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  44.7 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  39.91 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  41.28 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  40.09 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  39.19 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  39.17 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  39.63 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  36.62 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  26.73 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  27.33 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  27.8 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  27.31 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  33.56 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  24.88 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  31.01 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  26.79 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  29.33 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  31.39 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  28.29 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  26.03 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  27.1 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  24.43 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  29.75 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.19 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  26.22 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  26.45 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  29.03 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  27.46 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  28.87 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  28.48 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  25.17 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  25.78 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  26.28 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  29.71 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  30.15 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>