280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3716 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  100 
 
 		 255 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  71.14 
 
 		 242 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  67.45 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  75.62 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  75.62 
 
 		 245 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  75.21 
 
 		 247 aa  358  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  72.76 
 
 		 242 aa  357  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  66.67 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  60.66 
 
 		 235 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  60.08 
 
 		 235 aa  298  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  47.35 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  45.9 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  41.8 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  41.8 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  40.57 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  40.57 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  40.57 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0371  exsD protein  39.19 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  38.68 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 209 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 202 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.25 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  32.26 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 212 aa  85.5  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  39.1 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  35.2 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  29.53 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  28.15 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  39.69 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  28.99 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  29.44 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  28.74 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  27.78 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  30.36 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  39.84 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  37.4 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  30.22 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  31.53 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  30.22 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  29.53 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  29.44 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.27 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.27 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  27.82 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  32 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  29.94 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>