More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3632 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 211 aa  440  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  53.74 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  50.23 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  48.06 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  46.45 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  47.39 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  47.09 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  44.55 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  46.89 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  45.97 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  44.93 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  46.12 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  47.57 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  45.02 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  44.55 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  45.02 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  47.42 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  42.99 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  45.41 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  42.53 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  45.75 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  42.53 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  45.75 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  43.19 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  43.13 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  42.25 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  43.2 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  42.25 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  44.81 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  44.81 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  43.87 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  42.27 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  43.87 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  41.82 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  42.65 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  42.44 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  45.37 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  42.47 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  44.9 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  40.35 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  41.31 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 		 280 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 258 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  34.24 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.05 
 
 		 227 aa  88.2  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  40.46 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34.81 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  29.6 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  28.33 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  27.47 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.49 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  29.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  27.5 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  42.59 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.51 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  26.99 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>