293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0734 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0371  exsD protein  84.43 
 
 
212 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  60.67 
 
 
238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  63.75 
 
 
245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  59.41 
 
 
238 aa  308  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  59.41 
 
 
238 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  59.41 
 
 
238 aa  308  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  59.41 
 
 
238 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  59 
 
 
238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  59 
 
 
238 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  58.58 
 
 
238 aa  305  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  59 
 
 
238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  59.41 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  58.4 
 
 
238 aa  299  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  59.84 
 
 
244 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  51.48 
 
 
238 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  44.4 
 
 
242 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  42.92 
 
 
246 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  40.77 
 
 
235 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  42.68 
 
 
242 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  40.76 
 
 
235 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  41.25 
 
 
251 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  40.83 
 
 
247 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  40.98 
 
 
255 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  43.57 
 
 
245 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
209 aa  92.4  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  27.76 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  28.86 
 
 
206 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.93 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  27.46 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  29.47 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
216 aa  77  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  34.48 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  35.17 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  28.39 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  30.22 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  35.17 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  27.97 
 
 
212 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  28.09 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  29.61 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  31.21 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  30.29 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  30.39 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  25 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  29.44 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  27.08 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  27.08 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  26 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  27.16 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  28.63 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  28.36 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  28.07 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  25 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  34.51 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  28.9 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  28.57 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  27.5 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  34.75 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  26.84 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  33.1 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  28.33 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  28.07 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  27.39 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>