285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1270 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  51.98 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  34.77 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  34.78 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  33.6 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  33.46 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  35.2 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 265 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  32.43 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  32.27 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  35.9 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  32.82 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  32.81 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  24.9 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  39.77 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  25.93 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  38.64 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  38.04 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  42.05 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  36.26 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  25.21 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.34 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  32.82 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.97 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  38.46 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  30.23 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  34.41 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  35.66 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  32.71 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.77 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  25.1 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  34.78 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  33 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  32.35 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.97 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.97 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  34.07 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  32.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  33.01 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  31.78 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  31.3 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>