More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2965 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  94.02 
 
 		 251 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  59.35 
 
 		 250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  61.13 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  56.68 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  51.63 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  47.33 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  50.2 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  46.99 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  47.88 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  46.69 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  46.54 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  44.94 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  43.2 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  34.2 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  35.69 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  31.13 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.64 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.87 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  34.42 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  33.11 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  33.11 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  29.27 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.96 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  36 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  32.41 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  27.05 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  23.02 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  32.84 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  32.06 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  33.58 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.86 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.25 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  29.34 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  37.96 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.3 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  35.94 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  23.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  31.3 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  29.85 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  31.3 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  25.1 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  30 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  33.08 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.3 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0634  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.65 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000476119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  32.06 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1274  radical SAM family protein  34.4 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  34.29 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  25.31 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  27.86 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  31.06 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  31.06 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>