253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0823 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  71.77 
 
 
251 aa  358  3e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  52.4 
 
 
247 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  51.39 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  52.19 
 
 
247 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  50.58 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
241 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  49.4 
 
 
247 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.4 
 
 
251 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
258 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 
243 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
274 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 
227 aa  95.9  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 
280 aa  88.6  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  25.71 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  37.01 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 
216 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  37.1 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  35.94 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  35.2 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  35.43 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  36.29 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  36.29 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  36.29 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  37.6 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.81 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  27.75 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  34.4 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  26.53 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  34.38 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  26.98 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  30.82 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  26.16 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  34.13 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  27.75 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  32.85 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  27.56 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  30.19 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  28.79 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  33.59 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  31.93 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  31.93 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  26.78 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  25.61 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  34.11 
 
 
195 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.81 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  26.78 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 
245 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
210 aa  62.4  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
215 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  26.89 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  24.9 
 
 
222 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
217 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  32.81 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  37.01 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  31.75 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  31.75 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  31.75 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  26.7 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>