More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1702 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 222 aa  466  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  64.13 
 
 		 223 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  57.53 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  57.53 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  57.53 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  54.79 
 
 		 223 aa  245  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  55.5 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  49.53 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  46.7 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  47.64 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  48.65 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  45.07 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  45.28 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  46.54 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  44.44 
 
 		 215 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  45.37 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  43.52 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  43.52 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  44.91 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  43.52 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  45.37 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  44.65 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  42.33 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  43.98 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  44.34 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  43.78 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  43.06 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  42.18 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  41.86 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  40.83 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  40.67 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  41.1 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  41.1 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  37.16 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  35.78 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  38.2 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  35.32 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  41.21 
 
 		 193 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  37.9 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  35.41 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  34.58 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  34.09 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  41 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  42 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  26.73 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  42.72 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.87 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  32.39 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  29.91 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  29.15 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  29.91 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  30.4 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  27.65 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  40.57 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.11 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  29.2 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.23 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  25.94 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.78 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  27.85 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  26.47 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>