More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1071 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  98.62 
 
 		 217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  76.3 
 
 		 213 aa  348  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  74.88 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  68.25 
 
 		 227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  66.51 
 
 		 223 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  65.28 
 
 		 217 aa  288  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  64.45 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  63.98 
 
 		 215 aa  287  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  63.98 
 
 		 215 aa  287  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  64.45 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  64.45 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  63.51 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  64.81 
 
 		 217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  63.81 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  61.57 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  63.51 
 
 		 215 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  62.38 
 
 		 226 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  62.86 
 
 		 264 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  63.33 
 
 		 216 aa  279  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  61.14 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  62.56 
 
 		 215 aa  278  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  60.48 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  61.61 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  61.61 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  58.96 
 
 		 213 aa  267  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  58.96 
 
 		 213 aa  267  8e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  59.43 
 
 		 216 aa  264  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  58.96 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  62.91 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  58.1 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  64.06 
 
 		 193 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  51.11 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  50.67 
 
 		 244 aa  237  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  50.22 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  44.93 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  44.93 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  45.16 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  43.96 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  45.89 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  42.45 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  43.69 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  42.52 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  42.79 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  42.92 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  37.85 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  41.67 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.67 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  38.65 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.26 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  34.16 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 260 aa  91.7  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  41.28 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.36 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  29.53 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  29.22 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.22 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  24.65 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.47 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  28.92 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  37.19 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  37 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  38.83 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  27.47 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  29.71 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  34.4 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  32.37 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  34.4 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  32.37 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>