More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3334 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3334  ABC transporter related protein  100 
 
 		 334 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3054  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.374773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  60.25 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  51.53 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  54.39 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0316  ABC transporter related  50.2 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.000000000465057  decreased coverage  0.0034539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04180  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  55.46 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.40669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  48.74 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.75 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3807  ABC transporter related  51.67 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 		 378 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  39.64 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  50.48 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  33.14 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  44.08 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.31 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  48.32 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.81 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.57 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  43.56 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  40.41 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  42.63 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  40.41 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 363 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  40.41 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  44.54 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.12 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.98 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  42.22 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.03 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  44.53 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.03 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.03 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  36 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.2 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  37.9 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.16 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 		 384 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.42 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  47.86 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  46.58 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.31 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.04 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  45.53 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  48.57 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.39 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.12 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  45.98 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.91 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  45.77 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.45 
 
 		 390 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.91 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  52.13 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  45.19 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 		 388 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  46.58 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  38.58 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>