More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3387 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3387  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  71.7 
 
 
273 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 
283 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  41.29 
 
 
255 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  41.21 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  43.02 
 
 
285 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 
261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 
286 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  39.63 
 
 
269 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  35.48 
 
 
252 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 
246 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 
264 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.13 
 
 
260 aa  99  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  38.92 
 
 
257 aa  98.6  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  37.11 
 
 
248 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 
267 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.16 
 
 
260 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  34.97 
 
 
263 aa  93.2  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 
257 aa  92.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
284 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.18 
 
 
247 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  34.55 
 
 
271 aa  92.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.95 
 
 
247 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.95 
 
 
247 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  33.96 
 
 
247 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 
249 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  37.11 
 
 
266 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
244 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.25 
 
 
248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.25 
 
 
248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.25 
 
 
248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.25 
 
 
248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
513 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.25 
 
 
248 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  33.99 
 
 
271 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
248 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.69 
 
 
248 aa  87.8  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 
246 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
268 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.13 
 
 
248 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.68 
 
 
248 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.38 
 
 
248 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 
250 aa  86.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  34.57 
 
 
265 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  39.66 
 
 
246 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 
264 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.48 
 
 
252 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.36 
 
 
250 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.53 
 
 
247 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 
247 aa  85.9  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  35.44 
 
 
247 aa  85.1  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
246 aa  84.3  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
246 aa  84.3  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.36 
 
 
248 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.06 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.06 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  33.56 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.87 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.06 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  35.21 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.53 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.93 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.25 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  30.82 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  38.78 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.13 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.13 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  31.74 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.13 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.53 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  32.08 
 
 
256 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  32 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  32.08 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
277 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>