More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3922 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
317 aa  613  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0207094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 
317 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 
318 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0735009  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7531  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.63 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.670185  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
306 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.916546  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
314 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
324 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.781235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
313 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
313 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.07 
 
 
313 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
315 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
313 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
313 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  38.56 
 
 
313 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.52 
 
 
313 aa  222  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.74 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  40.52 
 
 
311 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.2 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  40 
 
 
298 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
313 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.153142  normal  0.0602666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
340 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.284622  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
314 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
311 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
315 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8312  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.19 
 
 
317 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.577715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
335 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
312 aa  208  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
318 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
314 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8180  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.14 
 
 
313 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
313 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
317 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
317 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  36.54 
 
 
313 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1971  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
312 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000886522  normal  0.331468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.34 
 
 
314 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
313 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
324 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  36.72 
 
 
337 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
315 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3251  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
312 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  33.33 
 
 
306 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  33.33 
 
 
306 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
312 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
313 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
315 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  38.32 
 
 
336 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.23 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
317 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  33.33 
 
 
306 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
306 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.83 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  38.02 
 
 
336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.86 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  37.72 
 
 
336 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.89 
 
 
326 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.51 
 
 
307 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.73 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
310 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
328 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  35.46 
 
 
305 aa  195  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  34.63 
 
 
316 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.42 
 
 
339 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0231  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 
318 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.87 
 
 
315 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
315 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1011  peptide ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 
317 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
326 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
313 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  38.02 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
308 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
318 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
327 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
320 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>