More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0938 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  605  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
317 aa  295  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0735009  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.7 
 
 
306 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.916546  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
317 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.14 
 
 
315 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
324 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.81 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  41.04 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
315 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
313 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.5 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.81 
 
 
336 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
336 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  41.12 
 
 
336 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  40.81 
 
 
336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.75 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
313 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
320 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  40.19 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
319 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
312 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
314 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
314 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  39.73 
 
 
298 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 
336 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.8 
 
 
336 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 
313 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
313 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.11 
 
 
313 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.33 
 
 
336 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  37.79 
 
 
313 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
317 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0207094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
332 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
313 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
336 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
334 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
321 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000414077  hitchhiker  0.00173265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
313 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  40.51 
 
 
310 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
315 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
334 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
314 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
313 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  39.88 
 
 
336 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  39.94 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
313 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
313 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
313 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
316 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
345 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  38.94 
 
 
336 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  37.82 
 
 
316 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.61 
 
 
313 aa  218  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
317 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  42.21 
 
 
317 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.02 
 
 
336 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.66 
 
 
313 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
316 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.56 
 
 
336 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.76 
 
 
308 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
315 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
315 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  39.02 
 
 
336 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  38.89 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39 
 
 
314 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
321 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.670185  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
308 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 
336 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
315 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
313 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8312  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.4 
 
 
317 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.577715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
315 aa  215  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
306 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
318 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  39.94 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1971  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.87 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000886522  normal  0.331468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  40.19 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  40.19 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>