More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3924 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3924  signal peptide peptidase A  100 
 
 		 682 aa  1316    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  65.05 
 
 		 651 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  40.99 
 
 		 569 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.49 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  37.96 
 
 		 623 aa  327  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.39 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  50.78 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  51.04 
 
 		 570 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  33.12 
 
 		 593 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.56 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.97 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.31 
 
 		 656 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.75 
 
 		 561 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.28 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  27.57 
 
 		 610 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.42 
 
 		 831 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.98 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.93 
 
 		 629 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.54 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.54 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.35 
 
 		 595 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  45.2 
 
 		 834 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  37.92 
 
 		 608 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.89 
 
 		 649 aa  160  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.62 
 
 		 604 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.38 
 
 		 640 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.4 
 
 		 834 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  39.06 
 
 		 618 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.4 
 
 		 834 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.35 
 
 		 875 aa  154  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.28 
 
 		 299 aa  153  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  34.33 
 
 		 621 aa  153  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  41.53 
 
 		 633 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.1 
 
 		 633 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.71 
 
 		 313 aa  152  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.93 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.37 
 
 		 595 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41 
 
 		 296 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.58 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.58 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.93 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.93 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 		 383 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.29 
 
 		 613 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  36.72 
 
 		 611 aa  147  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.29 
 
 		 348 aa  147  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.1 
 
 		 339 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  37.61 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  40.08 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  27.59 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  38.36 
 
 		 616 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  36.33 
 
 		 616 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  42.73 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.46 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.32 
 
 		 596 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.96 
 
 		 274 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.84 
 
 		 617 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.55 
 
 		 595 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.55 
 
 		 615 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.55 
 
 		 615 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.55 
 
 		 615 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.87 
 
 		 587 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 		 614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.85 
 
 		 613 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.78 
 
 		 590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.55 
 
 		 589 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.14 
 
 		 615 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.94 
 
 		 615 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  34.96 
 
 		 612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.66 
 
 		 613 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  39.19 
 
 		 583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.99 
 
 		 617 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.73 
 
 		 342 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  40.37 
 
 		 340 aa  140  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.34 
 
 		 613 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  35.82 
 
 		 583 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  39.15 
 
 		 536 aa  140  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.39 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.39 
 
 		 614 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  35.37 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.39 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.22 
 
 		 297 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  34.25 
 
 		 617 aa  138  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.29 
 
 		 614 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  37.34 
 
 		 618 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.69 
 
 		 597 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.31 
 
 		 613 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  36.48 
 
 		 616 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  37.76 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  40.64 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  40.64 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.51 
 
 		 561 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  32.32 
 
 		 616 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  40.64 
 
 		 622 aa  135  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  37.76 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  37.76 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  40.64 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  37.34 
 
 		 618 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.31 
 
 		 299 aa  134  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>