More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1225 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  100 
 
 		 555 aa  1046    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.98 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.38 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  32.34 
 
 		 566 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  34.33 
 
 		 569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  42.51 
 
 		 834 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.44 
 
 		 562 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.98 
 
 		 834 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.34 
 
 		 604 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.8 
 
 		 834 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.71 
 
 		 570 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.53 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.21 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.62 
 
 		 566 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.27 
 
 		 831 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  36 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  36.13 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  34.26 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.1 
 
 		 593 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.1 
 
 		 593 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  31.17 
 
 		 583 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.31 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.85 
 
 		 585 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.79 
 
 		 590 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.31 
 
 		 593 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.63 
 
 		 595 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.12 
 
 		 561 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.71 
 
 		 594 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  37.19 
 
 		 536 aa  213  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.04 
 
 		 595 aa  205  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30 
 
 		 590 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.57 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.57 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.03 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  29.82 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  30.02 
 
 		 611 aa  203  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.95 
 
 		 587 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.92 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  30.88 
 
 		 609 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.95 
 
 		 588 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.78 
 
 		 875 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.1 
 
 		 595 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.61 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  30.49 
 
 		 616 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.9 
 
 		 597 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  32.85 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  29.1 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.46 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.24 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  31.24 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  30.84 
 
 		 616 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.4 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  27.49 
 
 		 609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.29 
 
 		 614 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.29 
 
 		 614 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.07 
 
 		 613 aa  173  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.35 
 
 		 547 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  27.91 
 
 		 617 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.29 
 
 		 614 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.67 
 
 		 620 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.35 
 
 		 615 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  29.48 
 
 		 616 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  28.66 
 
 		 633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.4 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.49 
 
 		 617 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.06 
 
 		 613 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  28.57 
 
 		 618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  28.57 
 
 		 618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.45 
 
 		 633 aa  163  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.57 
 
 		 618 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  27.85 
 
 		 618 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  28.36 
 
 		 618 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  28.36 
 
 		 622 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  27.22 
 
 		 612 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  28.36 
 
 		 618 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  28.36 
 
 		 618 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.4 
 
 		 605 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.41 
 
 		 640 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.4 
 
 		 605 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  27.38 
 
 		 616 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  27.49 
 
 		 616 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  28.48 
 
 		 616 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.65 
 
 		 629 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.86 
 
 		 615 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  28.15 
 
 		 618 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.86 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  28.17 
 
 		 618 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  28.27 
 
 		 616 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.86 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.6 
 
 		 613 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.66 
 
 		 615 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.51 
 
 		 616 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  28.27 
 
 		 616 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.59 
 
 		 621 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.46 
 
 		 617 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  25.93 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.06 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  31.76 
 
 		 580 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  28.02 
 
 		 618 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  28.02 
 
 		 618 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>