168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1613 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  61.06 
 
 
540 aa  677    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  59.64 
 
 
544 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  70.44 
 
 
543 aa  782    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  57.97 
 
 
557 aa  654    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 
547 aa  1118    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  57.45 
 
 
559 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  55.86 
 
 
551 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  55.56 
 
 
543 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  38.22 
 
 
345 aa  270  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  41.88 
 
 
347 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  39.66 
 
 
340 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  39.66 
 
 
341 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  37.54 
 
 
340 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  37.14 
 
 
340 aa  259  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  39.54 
 
 
340 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.11 
 
 
341 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  40.11 
 
 
340 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  40.74 
 
 
344 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.92 
 
 
337 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  39.53 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  35.63 
 
 
337 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.26 
 
 
341 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  37.1 
 
 
341 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  37.25 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  38.22 
 
 
346 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  36.96 
 
 
339 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  35.26 
 
 
344 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  35.93 
 
 
330 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  33.63 
 
 
324 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.43 
 
 
324 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  37.21 
 
 
339 aa  196  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  39.22 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  43.62 
 
 
189 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  29.19 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  30.65 
 
 
329 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  31.44 
 
 
330 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.65 
 
 
544 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  31.25 
 
 
534 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.75 
 
 
539 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  31.87 
 
 
342 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  31.73 
 
 
546 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.14 
 
 
533 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.58 
 
 
534 aa  97.1  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.11 
 
 
533 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.96 
 
 
182 aa  94.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.45 
 
 
534 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  26.09 
 
 
342 aa  94.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  37.36 
 
 
247 aa  94.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.73 
 
 
533 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  26.89 
 
 
401 aa  90.1  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  31.1 
 
 
348 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.34 
 
 
534 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.52 
 
 
213 aa  88.2  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  26.89 
 
 
321 aa  87.4  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.47 
 
 
538 aa  87  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  30.3 
 
 
336 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  30.65 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  25.08 
 
 
319 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  27.43 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  29.72 
 
 
336 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.11 
 
 
194 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.65 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  31.64 
 
 
196 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.91 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  30.43 
 
 
341 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  24.35 
 
 
333 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  27.51 
 
 
575 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  37.5 
 
 
200 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  24.3 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  27.54 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  27.35 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  28.11 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  32.8 
 
 
202 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.32 
 
 
203 aa  66.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.85 
 
 
213 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.65 
 
 
191 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.81 
 
 
191 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.95 
 
 
205 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  30.27 
 
 
190 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  25 
 
 
336 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30 
 
 
191 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.67 
 
 
190 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.51 
 
 
228 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  30.46 
 
 
405 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0250  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.23 
 
 
210 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00242591  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0146  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.34 
 
 
192 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0329177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  41.77 
 
 
421 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  41.77 
 
 
421 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  41.77 
 
 
421 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.29 
 
 
176 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.21 
 
 
206 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0931  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  26.37 
 
 
213 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.74 
 
 
174 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3664  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.37 
 
 
212 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.985424  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.23 
 
 
187 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  32.61 
 
 
396 aa  54.7  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  23.88 
 
 
206 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.11 
 
 
196 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  39.39 
 
 
426 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  37.97 
 
 
430 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>