96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1756 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 
341 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  79.41 
 
 
342 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  67.93 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  63.96 
 
 
336 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  63.36 
 
 
336 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60 
 
 
533 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  59.21 
 
 
534 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60.3 
 
 
533 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  65.17 
 
 
336 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60 
 
 
533 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  57.58 
 
 
534 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  57.27 
 
 
534 aa  342  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  57.27 
 
 
534 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  58.86 
 
 
544 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.51 
 
 
538 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  51.81 
 
 
546 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.18 
 
 
539 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  46.53 
 
 
538 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  42.81 
 
 
319 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  41.74 
 
 
321 aa  241  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  41.74 
 
 
401 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  45.43 
 
 
575 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  42.77 
 
 
539 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  48.35 
 
 
334 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  47.75 
 
 
334 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  43.06 
 
 
357 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  46.18 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.02 
 
 
337 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  39.23 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  39.46 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  37.81 
 
 
332 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  37.46 
 
 
330 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  35.6 
 
 
347 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  31.9 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  31.04 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  29.85 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  32.51 
 
 
340 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  32.52 
 
 
330 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  33.23 
 
 
344 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  31.75 
 
 
340 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  32.93 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  29.54 
 
 
343 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.82 
 
 
341 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  31.9 
 
 
339 aa  123  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  30.34 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.19 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  27.64 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.64 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  27.55 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  30.87 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  31.1 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.47 
 
 
324 aa  113  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  31.07 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  33.09 
 
 
551 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.33 
 
 
557 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.68 
 
 
540 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  24.78 
 
 
341 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.41 
 
 
547 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  29.94 
 
 
544 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  24.69 
 
 
324 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
543 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  28.16 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.34 
 
 
559 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  27.62 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.52 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  32.19 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0161  molybdopterin binding domain-containing protein  29.37 
 
 
401 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  34.97 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2078  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  31.58 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.498327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1735  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.58 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000475702  hitchhiker  0.000109125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  33.87 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1025  molybdopterin molybdochelatase  28.57 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  24.58 
 
 
546 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0479  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  31.2 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.636707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02260  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  25.2 
 
 
592 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1527  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.01 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  34.88 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0131  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.15 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0083  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  30.71 
 
 
601 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1134  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  26.97 
 
 
606 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0985  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.33 
 
 
644 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.587268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0135  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.15 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0447  molybdenum cofactor synthesis domain protein  24.75 
 
 
642 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.583292  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0136  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.15 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  29.66 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1306  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.58 
 
 
636 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654369  normal  0.053504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2878  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.46 
 
 
644 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003508  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  24.41 
 
 
592 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0132  molybdopterin molybdochelatase  26.15 
 
 
444 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0126  molybdopterin molybdochelatase  26.15 
 
 
444 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0131  molybdopterin molybdochelatase  26.15 
 
 
444 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1802  molybdopterin biosynthesis protein  33.74 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00395707  normal  0.117386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2149  molybdenum cofactor synthesis domain protein  28.19 
 
 
408 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0131  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.15 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4769  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  23.89 
 
 
414 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000168017 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1894  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.1 
 
 
640 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.116253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>