65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0826 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  634    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  84.15 
 
 
329 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  53.44 
 
 
332 aa  295  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  39.06 
 
 
335 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  34.85 
 
 
340 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  36.25 
 
 
339 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  39.39 
 
 
544 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  35.54 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  31.82 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  40.54 
 
 
546 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  33.43 
 
 
340 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  34.86 
 
 
340 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  34.24 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.51 
 
 
538 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.36 
 
 
539 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  32.84 
 
 
343 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  36.78 
 
 
347 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.92 
 
 
533 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.23 
 
 
341 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.09 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  31.53 
 
 
341 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  38.48 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  37.07 
 
 
539 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  29.48 
 
 
337 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  37.08 
 
 
534 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  32.74 
 
 
344 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.21 
 
 
341 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  36.47 
 
 
319 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  32.93 
 
 
341 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.61 
 
 
533 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.34 
 
 
533 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.5 
 
 
534 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  36.17 
 
 
321 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  36.76 
 
 
534 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  36.17 
 
 
401 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.81 
 
 
538 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  30.73 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  38.48 
 
 
342 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.88 
 
 
534 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  35.82 
 
 
337 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  39.07 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  39.14 
 
 
336 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  35 
 
 
333 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.93 
 
 
557 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  36.76 
 
 
357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  37.65 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  34.03 
 
 
346 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  36.58 
 
 
334 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  37.75 
 
 
336 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  30.3 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.58 
 
 
324 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  32.13 
 
 
544 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.69 
 
 
575 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  36.53 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  30.06 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  30.45 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.04 
 
 
547 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.93 
 
 
540 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  35.42 
 
 
336 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  27.76 
 
 
339 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  29.22 
 
 
342 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  32.14 
 
 
543 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.45 
 
 
559 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  29.34 
 
 
551 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.21 
 
 
543 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>