212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1027 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  100 
 
 
343 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  49.85 
 
 
339 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  48.82 
 
 
341 aa  348  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  47.93 
 
 
340 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  47.49 
 
 
340 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  47.06 
 
 
340 aa  339  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  48.97 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  45.13 
 
 
345 aa  334  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  48.22 
 
 
347 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  49.27 
 
 
344 aa  330  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  48.38 
 
 
340 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.2 
 
 
337 aa  328  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  47.48 
 
 
341 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.59 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  46.9 
 
 
337 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  43.99 
 
 
341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  44.31 
 
 
346 aa  305  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  45.9 
 
 
335 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  43.34 
 
 
324 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  40 
 
 
330 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.6 
 
 
557 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  40.41 
 
 
544 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  46.72 
 
 
409 aa  242  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  41.47 
 
 
344 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.25 
 
 
547 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.35 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.82 
 
 
543 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.66 
 
 
540 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  38.44 
 
 
551 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  36.61 
 
 
339 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  37.21 
 
 
543 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.17 
 
 
559 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  33.53 
 
 
329 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  34.38 
 
 
332 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  32.93 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  29.85 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.53 
 
 
544 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  27.33 
 
 
539 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  27.55 
 
 
401 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  27.55 
 
 
321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  30.46 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.22 
 
 
539 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  29.14 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.1 
 
 
534 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  27.33 
 
 
534 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  28.22 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  25.93 
 
 
319 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.41 
 
 
534 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.11 
 
 
533 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  27.02 
 
 
534 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  29.23 
 
 
336 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  28.92 
 
 
336 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  29.54 
 
 
341 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.65 
 
 
533 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  27.99 
 
 
575 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.7 
 
 
538 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  28.61 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.87 
 
 
533 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  28.4 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.58 
 
 
538 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  25.08 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  24.78 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  24.13 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  24.33 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  23.51 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  33.33 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.46 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.46 
 
 
389 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1772  molybdenum cofactor synthesis domain protein  34.45 
 
 
649 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0138  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  27.21 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0447  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.14 
 
 
642 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.583292  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1693  molybdopterin biosynthesis protein  27.03 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0343522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1894  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  26.29 
 
 
640 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.116253  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5512  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.28 
 
 
422 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3707  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.9 
 
 
416 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  25.69 
 
 
405 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  34.12 
 
 
275 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1286  molybdopterin molybdochelatase  25 
 
 
403 aa  52.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.724523  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  26.43 
 
 
403 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1403  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.63 
 
 
166 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0446  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.24 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0138  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  25.7 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2125  bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MogA  27.03 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4377  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.23 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0205  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.08 
 
 
631 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0132  molybdopterin molybdochelatase  25.14 
 
 
444 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0126  molybdopterin molybdochelatase  25.14 
 
 
444 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0131  molybdopterin molybdochelatase  25.14 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4223  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.52 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1606  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0131  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.52 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4769  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.42 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000168017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1547  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  27.59 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4495  molybdopterin molybdochelatase  26.81 
 
 
402 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  23.12 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4646  molybdopterin molybdochelatase  23.93 
 
 
408 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.380612  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0135  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.52 
 
 
417 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0136  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.52 
 
 
417 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1163  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.59 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0131  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.52 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>