194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1573 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  686    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  76.99 
 
 
341 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  60 
 
 
340 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  59.29 
 
 
340 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  59.71 
 
 
345 aa  418  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  60.18 
 
 
340 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  59.59 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  59.29 
 
 
347 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  59.77 
 
 
346 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  52.06 
 
 
340 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  50.59 
 
 
341 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  49.85 
 
 
343 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  53.06 
 
 
344 aa  358  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  50.15 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  48.39 
 
 
341 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  47.2 
 
 
337 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.9 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  50.77 
 
 
330 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  47.42 
 
 
335 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  45.29 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  41.1 
 
 
324 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  40 
 
 
324 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.44 
 
 
540 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  39.59 
 
 
544 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  46.15 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  38.73 
 
 
551 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  38.51 
 
 
339 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.96 
 
 
547 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.8 
 
 
557 aa  235  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.42 
 
 
543 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.85 
 
 
559 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  37.5 
 
 
543 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  35.65 
 
 
329 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  36.25 
 
 
330 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  35.19 
 
 
332 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  32.41 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.53 
 
 
544 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.02 
 
 
533 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.54 
 
 
533 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.13 
 
 
538 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.4 
 
 
534 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  27.33 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  27.24 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.7 
 
 
534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  31.9 
 
 
546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.4 
 
 
534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.54 
 
 
533 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  27.58 
 
 
539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.13 
 
 
539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.33 
 
 
534 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.13 
 
 
538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  31.1 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  31.27 
 
 
342 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  31.1 
 
 
336 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  29.66 
 
 
333 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  30.34 
 
 
341 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  28.17 
 
 
348 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.99 
 
 
575 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  30.43 
 
 
336 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  24.77 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.3 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  27.33 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  27.3 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  27.52 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  26.77 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  30.03 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  38.14 
 
 
389 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.29 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  40 
 
 
434 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  36.56 
 
 
421 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  36.56 
 
 
421 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  35.48 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2433  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  37.5 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.190563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  26.35 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  26.29 
 
 
405 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  37.5 
 
 
430 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4093  molybdopterin binding domain-containing protein  29.22 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  32.91 
 
 
447 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  33.73 
 
 
426 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  32.21 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  36.25 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03854  molybdopterin biosynthesis protein  26.87 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13280  molybdenum cofactor biosynthetic protein A1  26.51 
 
 
407 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.29 
 
 
546 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0205  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.17 
 
 
631 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  27.78 
 
 
400 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5675  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  38.82 
 
 
173 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1313  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.21 
 
 
397 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2298  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.47 
 
 
419 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2125  bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MogA  26.03 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2340  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.47 
 
 
419 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1194  molybdenum cofactor biosynthetic protein A1  26.51 
 
 
407 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.185603  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2649  molybdopterin molybdochelatase  29.17 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0992  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.82 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1239  molybdopterin binding domain protein  24.83 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.382027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14130  Molybdenum cofactor biosynthesis protein, MoeA  28.99 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24600  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.49 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.306259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2121  molybdenum cofactor synthesis domain protein  34.44 
 
 
175 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1306  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.97 
 
 
636 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654369  normal  0.053504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>