148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0260 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 		 344 aa  699    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  49.12 
 
 		 341 aa  322  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  49.56 
 
 		 341 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  44.71 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  46.49 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  47.06 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.59 
 
 		 337 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  44.71 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  46.15 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  45.29 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  41.18 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  44.12 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  45.29 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  42.35 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  41.76 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  42.94 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  40.94 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  42.06 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  41.47 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  40.79 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.88 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  37.44 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  39.3 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.53 
 
 		 559 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  39.12 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.26 
 
 		 547 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  36.63 
 
 		 544 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  37.43 
 
 		 551 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.69 
 
 		 540 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.61 
 
 		 543 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.14 
 
 		 557 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  35.55 
 
 		 543 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  30.3 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  30.68 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.74 
 
 		 533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  27.57 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.45 
 
 		 533 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.62 
 
 		 533 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.07 
 
 		 538 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.32 
 
 		 539 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 544 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  27.43 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.26 
 
 		 534 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  27.99 
 
 		 539 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  26.84 
 
 		 534 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 534 aa  95.9  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.2 
 
 		 538 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  28.06 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  30.32 
 
 		 546 aa  93.6  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.51 
 
 		 534 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  27.36 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  27.36 
 
 		 401 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.74 
 
 		 575 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  26.75 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  27.16 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  30.12 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  27.37 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.58 
 
 		 546 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1542  molybdopterin molybdochelatase  26.75 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09038  molybdenum cofactor biosynthesis protein (MoeA), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15170)  28.47 
 
 		 442 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  32.43 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  40.79 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  29.5 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2242  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.88 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1584  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.63 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  34.15 
 
 		 447 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  33.61 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3248  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.15 
 
 		 403 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.15 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0086  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.1 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  34.21 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  30.54 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  35.8 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  37.04 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  33.75 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0128  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.56 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.79 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0114  MoeA-likedomain-containing protein  27.72 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  28.57 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0992  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.07 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0242  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.66 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0446176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4769  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.17 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000168017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3674  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  28.32 
 
 		 435 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0097  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.46 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.912543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  29.5 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.79 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3002  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  29.45 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0854249  hitchhiker  0.0000143204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4037  molybdopterin adenylyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  31.71 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  31.71 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>