More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2838 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2808  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  88.31 
 
 
403 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  100 
 
 
403 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3248  molybdenum cofactor synthesis domain protein  80.89 
 
 
403 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2455  MoeA-likedomain-containing protein  75.25 
 
 
403 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128685  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4495  molybdopterin molybdochelatase  72.21 
 
 
402 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  71.39 
 
 
404 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1730  MoeA-likedomain-containing protein  71.39 
 
 
404 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4674  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  56.33 
 
 
408 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5137  molybdenum cofactor synthesis domain protein  56.08 
 
 
408 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0281195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4372  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  53.75 
 
 
420 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5578  molybdenum cofactor synthesis domain protein  55.36 
 
 
407 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5392  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  56.61 
 
 
407 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5214  molybdenum cofactor synthesis domain protein  56.08 
 
 
408 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  51.6 
 
 
405 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0501  molybdenum cofactor synthesis domain protein  51.18 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2019  molybdenum cofactor synthesis domain protein  50.12 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00400246  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1824  molybdenum cofactor synthesis domain protein  50.5 
 
 
407 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1641  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  51.99 
 
 
401 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1418  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  51.81 
 
 
426 aa  350  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1411  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  50.74 
 
 
406 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1230  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  51.45 
 
 
401 aa  332  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.272239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3177  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  48.37 
 
 
403 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.587427  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1875  molybdopterin molybdochelatase  50.51 
 
 
398 aa  325  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.104621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1102  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.16 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1143  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  47.16 
 
 
404 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1802  molybdopterin biosynthesis protein  50.52 
 
 
402 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00395707  normal  0.117386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1136  MoeA-likedomain-containing protein  49.38 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2046  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  45.43 
 
 
404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.587796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0146  molybdenum cofactor synthesis domain protein  45.61 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0785571  normal  0.0383548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3097  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  55.36 
 
 
409 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1998  molybdopterin molybdochelatase  51.1 
 
 
394 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0708  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  50.28 
 
 
394 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4455  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  47.9 
 
 
411 aa  292  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3095  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  48.71 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.579686  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2141  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  47.31 
 
 
390 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3217  molybdopterin molybdochelatase  45.57 
 
 
395 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0439036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2028  molybdopterin molybdochelatase  42.63 
 
 
401 aa  255  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0833  MoeA-likedomain-containing protein  46.19 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117387  hitchhiker  0.00577528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2716  molybdopterin molybdochelatase  43.91 
 
 
396 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.363952 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1544  putative molybdopterin biosynthesis moea protein  42.97 
 
 
404 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571216  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2537  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  38 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1205  molybdenum cofactor synthesis domain protein  41.35 
 
 
419 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.0799464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1025  molybdopterin molybdochelatase  42.38 
 
 
397 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1964  MoeA-likedomain-containing protein  42.42 
 
 
411 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000165259  normal  0.334989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2132  molybdenum cofactor synthesis domain protein  41.05 
 
 
422 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3707  molybdenum cofactor synthesis domain protein  43.04 
 
 
416 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1452  molybdenum cofactor synthesis domain protein  36.97 
 
 
402 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1266  molybdenum cofactor synthesis domain protein  40.6 
 
 
419 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.997762 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5512  molybdenum cofactor synthesis domain protein  42.89 
 
 
422 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  46.27 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0138  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  38.04 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1876  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  42.08 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615539  hitchhiker  0.000063352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1894  molybdenum cofactor synthesis domain protein  43.44 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0387  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  39.61 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000355473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2819  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.26 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000411465  normal  0.114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2193  MoeA-likedomain-containing protein  43.39 
 
 
424 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00138326  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1991  molybdopterin binding domain-containing protein  42.94 
 
 
413 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6227  MoeA-likedomain-containing protein  42.08 
 
 
415 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3971  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  37.37 
 
 
599 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1852  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  42.08 
 
 
415 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2556  molybdenum cofactor synthesis domain protein  42.58 
 
 
414 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1330  putative molybdopterin biosynthesis MOEA protein  40.77 
 
 
419 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237789  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1278  molybdopterin molybdochelatase  37.28 
 
 
420 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0463678  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4081  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  37.12 
 
 
599 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4686  molybdenum cofactor synthesis domain protein  43.6 
 
 
396 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917234  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5153  molybdopterin binding protein, MoeA  43.56 
 
 
415 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1790  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  43.59 
 
 
415 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3203  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  42.31 
 
 
414 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802141  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5170  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  36.76 
 
 
407 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0933  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  39.95 
 
 
431 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1783  molybdopterin molybdochelatase  43.25 
 
 
402 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.648634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2151  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  41.86 
 
 
401 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1762  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  42.78 
 
 
415 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3878  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  36.62 
 
 
599 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1527  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.5 
 
 
415 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1567  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  39.58 
 
 
421 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2267  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoeA  40 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1144  molybdopterin biosynthesis moeA protein  40 
 
 
430 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2394  molybdopterin biosynthesis moeA protein  40 
 
 
442 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0024  molybdopterin biosynthesis moeA protein  40 
 
 
430 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1872  molybdopterin biosynthesis moeA protein  40 
 
 
432 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1382  molybdopterin biosynthesis moeA protein  40 
 
 
442 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2229  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoeA  40 
 
 
442 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439093  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0034  molybdenum cofactor synthesis domain protein  39.3 
 
 
407 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4646  molybdopterin molybdochelatase  42.43 
 
 
408 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.380612  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3585  molybdenum cofactor synthesis domain protein  39.43 
 
 
403 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0316578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0132  molybdopterin molybdochelatase  37.84 
 
 
444 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0126  molybdopterin molybdochelatase  37.84 
 
 
444 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0070  molybdenum cofactor synthesis domain protein  39.22 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1496  molybdopterin molybdochelatase  40.81 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1421  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  42.78 
 
 
426 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162468  normal  0.0104604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0138  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  36.65 
 
 
417 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2109  molybdenum cofactor synthesis domain protein  40.36 
 
 
414 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.635133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4632  molybdopterin biosynthesis moeA protein  34.18 
 
 
410 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3130  MoeA-likedomain-containing protein  38.12 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0120  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  35.98 
 
 
601 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0462  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  37.2 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5216  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  40.33 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.535606  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0131  molybdopterin molybdochelatase  37.84 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0083  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  34.21 
 
 
601 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>