More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0642 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 
347 aa  681    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  60 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  58.7 
 
 
340 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  53.91 
 
 
345 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  59.29 
 
 
339 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  57.99 
 
 
341 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  55.06 
 
 
340 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  56.64 
 
 
340 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  54.93 
 
 
340 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  52.06 
 
 
341 aa  359  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  50.89 
 
 
340 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  47.06 
 
 
341 aa  352  8e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  54.36 
 
 
344 aa  345  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  48.22 
 
 
343 aa  332  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  47.16 
 
 
341 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.27 
 
 
337 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  45.97 
 
 
337 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  48.94 
 
 
335 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  47.99 
 
 
330 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  44.97 
 
 
544 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  42.57 
 
 
540 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  46.15 
 
 
344 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  41.56 
 
 
324 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  41.88 
 
 
547 aa  269  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  42.61 
 
 
551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  43.49 
 
 
559 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.88 
 
 
557 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  42.69 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  42.57 
 
 
543 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  37.62 
 
 
324 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  47.25 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.12 
 
 
543 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  38.18 
 
 
329 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  38.94 
 
 
544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  34.27 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  36.47 
 
 
330 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.83 
 
 
533 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  37.27 
 
 
546 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  36.15 
 
 
534 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.6 
 
 
539 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  32.66 
 
 
401 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  32.66 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.93 
 
 
533 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  37.77 
 
 
336 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.85 
 
 
538 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  37.77 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.47 
 
 
534 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
533 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.8 
 
 
534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  36.42 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  37.15 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.42 
 
 
534 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  29.81 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  35.6 
 
 
341 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  30.03 
 
 
319 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  31.7 
 
 
539 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.81 
 
 
538 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  34.98 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.84 
 
 
575 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  29.5 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  32.83 
 
 
334 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  30.25 
 
 
337 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  33.03 
 
 
334 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  31.29 
 
 
357 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1334  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  31.13 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1239  molybdopterin binding domain protein  26.13 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.382027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4686  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.61 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917234  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2525  molybdenum cofactor synthesis domain protein  35.62 
 
 
389 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2433  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  37.17 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.190563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2132  molybdopterin adenylyltransferase  33.94 
 
 
162 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.635081  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2621  molybdenum cofactor synthesis domain protein  34.93 
 
 
389 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0293542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  31.16 
 
 
396 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  32.89 
 
 
403 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6966  molybdopterin binding protein, MoeA  27.89 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1505  molybdopterin molybdochelatase  30.32 
 
 
400 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.265063  normal  0.741192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0034  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.89 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3248  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.19 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0178  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.13 
 
 
546 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.876746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1840  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  33.11 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4037  molybdopterin adenylyltransferase  32.31 
 
 
197 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1772  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.06 
 
 
649 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1693  molybdopterin biosynthesis protein  32.86 
 
 
401 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0343522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1584  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.78 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  38.75 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1547  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  31.87 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2149  molybdenum cofactor synthesis domain protein  27.7 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  38.55 
 
 
421 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1313  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.7 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3002  molybdopterin biosynthesis protein MoeA  28.75 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0854249  hitchhiker  0.0000143204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  38.55 
 
 
421 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  36.71 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09038  molybdenum cofactor biosynthesis protein (MoeA), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15170)  30.83 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  32.06 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2277  molybdopterin binding domain-containing protein  24.06 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  37.35 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0462  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.22 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1278  molybdopterin molybdochelatase  30.13 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0463678  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0011  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.06 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0920  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  32.86 
 
 
644 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0353995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>