71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0332 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 336 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  82.88 
 
 		 334 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  81.98 
 
 		 334 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  56.66 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  55.03 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  52.51 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  48.37 
 
 		 538 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.79 
 
 		 539 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  45.05 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.97 
 
 		 538 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  46.73 
 
 		 539 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  46.13 
 
 		 546 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.01 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  42.6 
 
 		 534 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.32 
 
 		 533 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  42.81 
 
 		 534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.62 
 
 		 533 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  47.31 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  46.57 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.59 
 
 		 534 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  45.37 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  46.27 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  41.92 
 
 		 534 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  38.51 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  38.58 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  41.74 
 
 		 575 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  38.58 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  44.01 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  34.26 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  36.01 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.92 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  28.09 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  27.3 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  27.43 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  30.21 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  30.65 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  28.79 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  25.3 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  28.27 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  25.46 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  28.18 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  24.78 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  23.49 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.48 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  24.06 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.77 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  24.16 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  26.28 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.54 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  27.89 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  23.44 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  21.71 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.02 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  23.13 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.5 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1664  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  33.33 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869903  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3618  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  33.33 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649315  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  30.63 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2123  molybdopterin biosynthesis MoeA protein  33.33 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  30.48 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  30.48 
 
 		 405 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>