157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1566 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 
557 aa  1131    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  57.97 
 
 
547 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  58.5 
 
 
543 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  57.46 
 
 
544 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  53.86 
 
 
540 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  53.25 
 
 
551 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  53.02 
 
 
559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  51.47 
 
 
543 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  39.47 
 
 
341 aa  273  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  38.66 
 
 
340 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  40.35 
 
 
340 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  39.88 
 
 
347 aa  264  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  38.12 
 
 
345 aa  262  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  42.9 
 
 
344 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  39.3 
 
 
340 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  40.96 
 
 
335 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.71 
 
 
337 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  38.42 
 
 
337 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  38.6 
 
 
343 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  38.6 
 
 
340 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  38.6 
 
 
340 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.84 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  37.93 
 
 
346 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  36.36 
 
 
341 aa  230  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.26 
 
 
341 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  34.8 
 
 
339 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  39.88 
 
 
330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  34.56 
 
 
324 aa  212  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  35.47 
 
 
324 aa  211  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  35.22 
 
 
339 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  33.14 
 
 
344 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  38.71 
 
 
409 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  44.44 
 
 
189 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.71 
 
 
544 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  30.24 
 
 
329 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  30.56 
 
 
332 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  30.33 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  28.01 
 
 
401 aa  107  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  28.01 
 
 
321 aa  104  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.11 
 
 
533 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  24.06 
 
 
342 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  29.25 
 
 
342 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.76 
 
 
533 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  27.73 
 
 
546 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  26.35 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.97 
 
 
534 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.16 
 
 
539 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.98 
 
 
533 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.54 
 
 
534 aa  94.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.45 
 
 
534 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  33.33 
 
 
247 aa  90.1  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.5 
 
 
182 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.33 
 
 
534 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.96 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  24.58 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  27.89 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  27.94 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  24.76 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  30.43 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  27.62 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.11 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  27.22 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.57 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.42 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  25.51 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.09 
 
 
194 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  22.76 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  22.76 
 
 
334 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.82 
 
 
200 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.82 
 
 
196 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  25.43 
 
 
357 aa  63.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2019  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.1 
 
 
407 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00400246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.4 
 
 
575 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.06 
 
 
190 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5512  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.97 
 
 
422 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1824  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.86 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.09 
 
 
187 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  23.62 
 
 
191 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  25.13 
 
 
191 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  25.71 
 
 
190 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.81 
 
 
202 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.94 
 
 
203 aa  57.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3707  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.36 
 
 
416 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  21.85 
 
 
336 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.86 
 
 
223 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2088  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.18 
 
 
176 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000187806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2371  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.29 
 
 
213 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0146  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30.67 
 
 
401 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0785571  normal  0.0383548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  38.2 
 
 
205 aa  54.3  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.14 
 
 
228 aa  54.3  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.29 
 
 
191 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  26.32 
 
 
405 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4686  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.33 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917234  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24910  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  31.3 
 
 
405 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.07 
 
 
206 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.71 
 
 
204 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2125  bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MogA  38.55 
 
 
314 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0795  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  27.84 
 
 
194 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2130  molybdenum cofactor biosynthesis protein A2  31.3 
 
 
405 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.19 
 
 
270 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>